我们将利用Affymetrix公司的软件系统:MicroArray Suite, MicroDB以及Data Mining Tool 进行数据分析处理。根据客户的分析要求,我们将提供以下方面的数据及分析结果:
1. jpg格式芯片扫描原始图像。

2. 芯片的原始数据,包括原始的.DAT、.EXP和.CEL文件。
3.Excel文件形式提供每张芯片的分析结果。包含样品中所有基因的Signal、Detection和Detection p-value等信息。
4.每张芯片的Report文件。包含样品的制备质量和芯片杂交的总体信息。
5.对不同的样本进行基因差异表达的比较分析,比较分析的次数不多于客户要求服务的芯片数。并以Excel格式提供所有基因在不同芯片中表达差异分析。得到Change p-value, Increase 或 Decrease等信息。
6.提供不同样本比较分析散点图(Scatter Graph)。可以直观地反映两者信号值强度的整体差异及分布。(分析次数不超过客户要求服务的芯片数目。如客户杂交3张芯片,我们将提供3张散点图)。
|